Импорт в Blender и экспорт из него, текстуры

Во вкладке Блендера UV, в левом окне, посмотри, какие пути у текстур. При импорте в Блендер пути с материалами подгружаются, а сами текстуры нет. Скорее всего, нужно просто закинуть текстуры в папку с моделью.
Об окне и вкладке посмотри тут

При экспорте, если у тебя установлен плагин для mdl mdx, в настройках каждого материала должен быть пункт MDL Material settings, в нем собственно и делаешь нужный материал, его свойства и прописываешь пути текстур blp, потом экспортируешь модель в mdl mdx
Если все сделано правильно, то в war3 model editor модель будет уже с текстурами.

В настройках плагина можно указать путь к распакованному корню варкрафта для загрузки текстур

Но там вроде какой-то баг был с загрузкой текстур у mdx1100-моделей, хз пофикшен или нет. Если нет, то в ретере можно делать Assign v1000 в меню Scripts