Имеется ли способ заменить данные иконки на другие?

Это относится к каждой запущенной программе индивидуально.

в данный момент я имел ввиду иконку заряда батареи на ноуте, иконку подключения по локальной сети, безопасное извлечение устройства, пока всё) Вот их возможно изменить?

Скорее всего, они хранятся в контейнере бинарника Systray.exe, попробуй посмотреть, какие там иконки (любым ярлыком). Если это они - тебе надо открыть контейнер и изменить ресурсы на свои. Например, visual studio может открывать exe/dll контейнеры. Но не гарантированно, что он после этого будет норм работать, так что сделай бекап =)