Игра начинается 1 января 1665 года. У двух персонажей — обычное начало, оставшееся ещё от «Корсары: Возвращение легенды», а третий — Питер Блад, ирландский врач, которому ещё предстоят многие трудности, прежде чем попасть на обширные территории Карибского моря. С ним игра начинается в одном из поместий Англии. Он прибыл туда, чтобы излечить больного. Ему помогает его помощник, а позже и штурман — Джереми Питт. После приключений в поместье нас переносит на плантации Барбадоса, откуда мы и начнём наш путь в пиратскую карьеру. После приключений в городе мы захватываем фрегат «Синко Льягас», и тут-то начинается пиратская жизнь. В игре, по сравнению с предыдущими играми серии, изменено фехтование, некоторые аспекты управления и так далее.

Игрок может выбрать одного из трёх разных персонажей. У каждого есть отдельная сюжетная линия и класс.

Как и в предыдущих играх, в игре много мечей и ружей, каждое из которых имеет свои особенности.

Чтобы добиться успеха, персонаж игрока должен развить семь основных качеств. Это «новая ролевая система игры про пиратов».

Как и в предыдущих играх, на выбор предлагается множество реальных типов кораблей того периода. У игрока может быть более одного корабля, а в некоторых случаях и вовсе ни одного. Корабли различаются по стоимости в зависимости от того, насколько они хороши. Некоторые корабли нельзя купить, их нужно захватить в море. Некоторые корабли доступны только после выполнения определенных квестов.