Такое происходит не в первый раз. Обычно после установки нового скелета на модель - часть модели во время анимации попросту пропадает (становится невидимой) - более того, отсутсвуют сами полигоны (только скелет)... В чем дело и как с этим бороться?

Если полигоны пропадают единично — выделяешь полигон и жмёшь на «отразить нормали».
Если сразу поверхностями — это настройки видимости, удобней всего редактировать через WAR3ME, «редактор анимаций поверхностей».

С этим справился, теперь другая проблема. В игре не отображается сама модель (полигоны, текстуры), отображается только источник частиц который я прицепил к модели..

FKoFF, а в редакторе зелёный куб или тоже частицы есть?