Нам не потребуется никаких изменений в ядре. Было протестировано на Trinity Core. Хотя, должно работать и на других системах. Но, на других системах увеличивается сложность,так как придется изменять ядро.

Map.dbc
Areatable.dbc

Открываем Map.dbc. Ищем строчку 64 (ExpansionID). Меняем номер "Expansion" для континета на 1,но лучше на 2. Сохраняем. Устанавливаем в клиент и на сервер.
Открываем Areatable.dbc. Ищем строчку 5 (Flag). Добавляем 0x00004400 в зону, в которой мы хотим активировать полеты.Сохраняем. Устанавливаем в клиент и на сервер.

Игрок и сервер должен иметь .dbc файл с измененным флагом.
Map.dbc должен иметь измененный expansion id, чтобы активировать полеты.
Если хотите чтобы игроки могли летать не везде, поставьте ограничения (в Noggit Impassible Flag или каким-нибудь другим способом). Правда, вы не слезаете с маунта, когда залетаете в зону где полеты запрещены. Просто не сможете вызвать маунта снова.
Кроме предметов в которых написано что-то типо "Используется только в зоне ...", можно спокойно активировать любого маунта, предназначенного для определеной зоны (пример: Item ID 40600 дляBone Gryphon)
Может, а может и нет, иметь проблемы с кастомными континентами (.wdt может поломаться).